Berikut adalah fungsi Cawangan Industri Domestik:

• Merancang, memantau dan menilai aktiviti pembangunan industri makanan
• Menyediakan prosedur dan garis panduan aktiviti industri makanan di peringkat domestik.
• Melaksanakan aktiviti perlesenan ais serta perlesenan punca air minuman berbungkus, air mineral semulajadi.
• Urusetia mesyuarat Jawatankuasa Teknikal Air Minum yang dianggotai oleh pelbagai agensi.
• Memposes dan mengeluarkan lessen bagi pelesenan ais serta perlesenan punca air minuman berbungkus, air mineral semulajadi.
• Membangunkan dan mengemaskini garis panduan berkaitan serta perlesenan punca air minuman berbungkus, air mineral semulajadi.
• Melaksana kawalan keselamatan makanan di sepanjang rantaian bekalan makanan.
• Mengenalpasti komoditi makanan spesifik bagi melaksanakan kawalan keselamatan makanan di sepanjang rantaian bekalan makanan mengikut keutamaan.
• Merangka insentif kepada industri makanan yang memenuhi keperluan kawalan keselamatan makanan di sepanjang rantaian bekalan makanan.
• Membangunkan garis panduan yang berkaitan bagi melaksanakan kawalan keselamatan makanan di sepanjang rantaian bekalan makanan.
• Mengadakan kerjasama strategik dengan pihak berkepentingan yang terlibat dalam kawalan keselamatan makanan di sepanjang rantaian bekalan makanan.